В обязанности учреждений и специалистов ветеринарной службы, обслуживающих рыбопромысловые водоемы, входит:
    1. охрана водоемов от заноса заразного начала и попадания токсичных для рыб веществ;
    контроль их санитарного и эпизоотического состояния;
    2. организация и проведение карантинных и других ветеринарно-санитарных мероприятий при появлении заразных болезней рыб;
    3. контроль ветеринарно-санитарного качества отлавливаемой рыбы.
     Охрана рыбохозяйственных водоемов от проникновения в них возбудителей заразных болезней рыб и гидробионтов заключается в повседневном контроле за перевозками живой рыбы, раков, оплодотворенной икры и живых кормовых водных организмов. Любой ввоз и вывоз этих объектов должен быть санкционирован ветеринарными органами и проведен под контролем ветеринарных учреждений, в зоне деятельности которых находится данный водоем.
     Всю завозимую из других водоемов рыбу для разведения карантинируют - выдерживают в небольшом изолированном водоеме (пруду).
     Охрану водоемов от попадания в них токсичных для рыб и других гидробионтов стоков осуществляет ветеринарная служба.
     Каждый рыбопромысловый водоем 2 раза в год обследуют для определения его эпизоотического состояния, а также для выяснения ветеринаро-санитарного качества рыбных запасов. Такое обследование проводят в начале лета и осенью, в начале и конце летнего промыслового лова рыбы.
     При эпизоотическом обследовании выясняют благополучие рыб по заразным болезням, а при ветеринарно-санитарном - отсутствие возбудителей, которые могут вызвать заболевание людей и животных, а также ядохимикатов и поражений рыб, снижающих качество рыбы-сырца.